Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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NEDD8Q15843 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NEDD8Q15843 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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