Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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