Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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BRD3Q15059 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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BRD3Q15059 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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BRD3Q15059 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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BRD3Q15059 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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BRD3Q15059 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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BRD3Q15059 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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BRD3Q15059 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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BRD3Q15059 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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BRD3Q15059 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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