Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms