Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FRMPD4Q14CM0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMPD4Q14CM0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms