Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms