Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms