Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CKAP5Q14008 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CKAP5Q14008 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CKAP5Q14008 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CKAP5Q14008 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CKAP5Q14008 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CKAP5Q14008 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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