Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PKP1Q13835 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PKP1Q13835 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PKP1Q13835 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PKP1Q13835 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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PKP1Q13835 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PKP1Q13835 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PKP1Q13835 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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PKP1Q13835 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PKP1Q13835 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP1Q13835 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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