Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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