Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms