Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms