Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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