Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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