Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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