Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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