Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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