Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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