Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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BPTFQ12830 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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BPTFQ12830 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BPTFQ12830 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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BPTFQ12830 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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BPTFQ12830 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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