Protein–RNA interactions for Protein: Q09FC8

ZNF415, Zinc finger protein 415, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF415Q09FC8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ZNF415Q09FC8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF415Q09FC8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms