Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms