Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms