Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVR1Q04771 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms