Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CREMQ03060 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CREMQ03060 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms