Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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