Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DEFA5Q01523 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms