Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX1P83916 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms