Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UFM1P61960 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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UFM1P61960 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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UFM1P61960 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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UFM1P61960 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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UFM1P61960 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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