Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ACTBP60709 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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