Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms