Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSCP56915 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSCP56915 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms