Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms