Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms