Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC11A1P49279 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms