Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PPARGP37231 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PPARGP37231 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGP37231 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGP37231 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGP37231 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGP37231 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGP37231 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms