Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBRP36941 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBRP36941 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTBRP36941 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms