Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA3P35244 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms