Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHMLP26374 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms