Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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