Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNB1P20700 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms