Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DESP17661 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DESP17661 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms