Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms