Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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