Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms