Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms