Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP2AP11388 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms