Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNB1P11230 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms