Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMC1P11047 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms