Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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