Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLBP06746 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLBP06746 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms